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Linux

OSのパッケージマネージャを使ってたくさんインストールするのではなく、OSが管理するのはpip、pyenv、virtualenvを動かすのに必要なPython本体に留めて、実行環境はそれらで管理するのがいい。http://stat.inf.uec.ac.jp/doku.php?id=python:how_to_use:macosと同様の手順を薦める。